生信漫卷

文章/答案/技术大牛

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LV2

发表了文章 4天前2025-06-12 14:10:25

🤩 Journal Club | 川芎来源碳点缓解心肌再灌注损伤的硬核机制！~

心肌缺血-再灌注损伤（Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury, MIRI）是心梗治疗中的“隐形杀手”，由于再灌注带来的氧...

生信漫卷 4天前2025-06-12 14:10:26

数据、统计、网络、ros、模型

发表了文章 6天前2025-06-10 13:56:22

🤩 GeneNMF | 单细胞非负矩阵分解这样做更简单！~

GeneNMF 是一个专门针对基因表达数据设计的非负矩阵分解（NMF）工具包，旨在从高维组学数据中提取具有生物学意义的基因模块。🧬

生信漫卷 6天前2025-06-10 13:56:22

函数、数据、axis、element、程序

发表了文章 22天前2025-05-25 15:06:55

🤩 Journal Club | 单细胞测序揭示线粒体钙信号影响内皮-间质转化！~

EndMT（Endothelial-to-Mesenchymal Transition）是一种在心血管发育和多种疾病（如动脉粥样硬化、肺动脉高压、心脏纤维化等...

生信漫卷 22天前2025-05-25 15:06:55

marker、程序、模型、重构、迁移

发表了文章 28天前2025-05-19 11:35:56

🤩 miRTalk | 单细胞miRNA推断及细胞间通讯！~

3️⃣ 第三部分是可视化miRNA介导的细胞间通讯网络和miRNA-靶点相互作用网络。

生信漫卷 28天前2025-05-19 11:35:56

data、object、plot、可视化、网络

发表了文章 2025-05-122025-05-12 20:30:32

🤩 Journal Club | 机械力触发自组装的中草药水凝胶用于伤口愈合！~

该研究开发了一种机械力触发自组装的中草药水凝胶（hydrogel），用于伤口愈合。

生信漫卷 2025-05-122025-05-12 20:30:33

开发、模型、统计、cs、基础

发表了文章 2025-05-042025-05-04 14:27:42

🤩 scanpy | 超高速完成单细胞分析！~（一）（预处理与聚类）

看现在的趋势，未来python可能才是未来，R再不做出改变就要被取代了。🙂‍↕️

生信漫卷 2025-05-042025-05-04 14:27:42

数据、统计、sample、对象、可视化

发表了文章 2025-04-282025-04-28 12:52:12

🤩 enrichment_all | 一键完成富集分析！~（配高颜值可视化！）

最近做这些富集分析实在太烦了，我就自己写了2个函数，run_enrichment_all()和plot_enrichment_all()。😂

生信漫卷 2025-04-282025-04-28 12:52:12

函数、可视化、配色、csv、plot

发表了文章 2025-04-212025-04-21 17:05:25

🤩 mLLMCelltype | 多种大语言模型助力细胞类型注释！~

最近发现了一个AI辅助的注释工具，非常不错，原作者也是向我毛遂自荐，用了一下确实不错。👍

生信漫卷 2025-04-212025-04-21 17:05:25

框架、模型、数据、对象、可视化

发表了文章 2025-04-132025-04-13 17:13:52

🤩 Journal Club | 单细胞多组学分析揭示巨噬细胞亚群在心脏修复中的作用

心血管疾病是全球主要死因，心肌梗死（MI）后心脏修复过程复杂，涉及炎症反应与组织修复的平衡。🫠

生信漫卷 2025-04-132025-04-13 17:13:52

程序、基础、模型、网络、重构

发表了文章 2025-04-062025-04-06 21:55:25

🤩 Journal Club | 多组学整合揭示炎症与前肥大软骨细胞驱动骨关节炎软骨退变

本研究整合单细胞转录组（scRNA-seq）、空间转录组（Geo-seq）、GWAS和bulk RNA-seq数据，系统揭示OA膝关节软骨退变的细胞与分子机制。...

生信漫卷 2025-04-062025-04-06 21:55:26

网络、系统、医疗、proc、数据

发表了文章 2025-03-312025-03-31 19:20:35

🤩 Journal Club | 单细胞与空间转录组学揭示骨骼肌纤维化中的关键巨噬细胞亚群

肌肉不仅是运动的引擎，更是高度动态的组织。在健康状态下，巨噬细胞像“维修工”一样清除损伤碎片、促进再生。😘

生信漫卷 2025-03-312025-03-31 19:20:36

进程、模型、数据、异常、mdx

发表了文章 2025-02-052025-02-05 15:49:34

🤩 velocyto.R | 可以用R语言做单细胞RNA速率啦！~

生信漫卷 2025-02-052025-02-05 15:49:34

可视化、数据、cell、colors、velocity

发表了文章 2025-01-072025-01-07 14:10:52

🤩 Cellchat | 空间转录组也可以做细胞通讯啦！~（二）（多个数据集篇）

CellChat是一个专门用于分析细胞间通信的强大工具，现在也是支持空间转录组的分析了。🧐

生信漫卷 2025-01-072025-01-07 14:10:52

通信、网络、data、可视化、数据

发表了文章 2024-11-262024-11-26 09:12:09

🤩 scDiffCom | 看过来吧！~细胞间通讯怎么做差异分析呢！？

该工具包结合了最新的生物学知识库和单细胞表达数据，通过识别配体-受体相互作用来揭示细胞间的信号传递关系。💪

生信漫卷 2024-11-262024-11-26 09:12:10

数据、数据库、cell、object、可视化

发表了文章 2024-11-232024-11-23 09:12:35

🤩 Cellchat | 空间转录组也可以做细胞通讯啦！~（一）（单个数据集篇）

CellChat 2 现在支持多种数据类型，除了单细胞转录组数据（scRNA-seq），还扩展支持空间转录组数据（spatial transcriptomic...

生信漫卷 2024-11-232024-11-23 09:12:35

spatial、可视化、数据、网络、data

发表了文章 2024-11-232024-11-23 09:11:51

🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑！~（三）

TrendCatcher是一个用于RNA-seq数据动态通路行为分析的R包，尤其适合比较两组数据（例如对照组与处理组）在多个时间点的通路变化差异。💪

生信漫卷 2024-11-232024-11-23 09:11:51

数据、统计、list、可视化、量化

发表了文章 2024-11-232024-11-23 09:11:07

🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑！~（二）

今天继续之前的TrendCatcher，大家做完时序上的差异基因，然后就是想知道这些基因的功能，这就要用到富集分析了。🧐

生信漫卷 2024-11-232024-11-23 09:11:07

go、heatmap、time、工作、数据

发表了文章 2024-11-232024-11-23 09:10:23

🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑！~（一）

TrendCatcher 是一个专门用于识别时间序列数据中关键趋势变化的 R 包，特别适用于动态的生物学或医学研究场景，如单细胞转录组测序数据的时间或伪时间序列...

生信漫卷 2024-11-232024-11-23 09:10:24

可视化、模型、数据、list、table

发表了文章 2024-11-232024-11-23 09:09:33

🤩 scRank | Cool~单细胞测序数据推断药物反应性！~

在这个美好的中秋佳节，愿你的生活如月光般明亮，事业如圆月般圆满，心中永远充满温暖与喜悦。😀

生信漫卷 2024-11-232024-11-23 09:09:33

网络、函数、可视化、模块化、数据

发表了文章 2024-11-232024-11-23 09:08:43

🤩 Ragas | 有手就行！分分钟上手的单细胞分析R包！~

运行RunFindAllMarker从Seurat调用FindAllMarkers。😘

生信漫卷 2024-11-232024-11-23 09:08:43

list、object、可视化、入门、数据

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